柠檬因其味极酸，因为孕妇最喜食，故称益母果或益母子。柠檬中含有丰富的柠檬酸，因此被誉为“柠檬酸仓库”。它的果实汁多肉脆，有浓郁的芳香气。因为味道特酸，故只能作为上等调味料，用来调制饮料菜肴、化妆品和药品。 此外，柠檬富含维生素C，能化痰止咳，生津健胃。用于支气管炎，百日咳，食欲不振，维生素缺乏，中暑烦渴等症状，它是"坏血病"的克星。
柠檬富含维生素C、糖类、钙、磷、铁、维生素B1、维生素B2、烟柠檬酸、奎宁酸、柠檬酸、苹果酸、橙皮苷、柚皮苷、香豆精、高量钾元素和低量钠元素等，对人体十分有益。维生素C能维持人体各种组织和细胞间质的生成，并保持它们正常的生理机能。人体内的母质、粘合和成胶质等，都需要维生素C来保护。当维生素C缺少了，细胞之间的间质——胶状物也就跟着变少。这样，细胞组织就会变脆，失去抵抗外力的能力，人体就容易出现坏血症，它还有更多用途，如预防感冒、刺激造血和抗癌等作用。
明朝药学家李时珍所著《本草纲目》中记载柠檬具有生津、止渴、祛暑等功能。柠檬果汁，性味苦、温、无毒。《陆川本草》说柠檬果实、皮汁等具有疏滞、健胃、止痛、治郁滞腹痛不思饮食”等效能。现代医学认为柠檬是预防心血管病的药食。由于柠檬酸在人体内与钙离子结合成一种可溶性络合物，从而缓解钙离子有促进血液凝固的作用。因此，高血压、心肌梗塞患者常饮柠檬水，对改善症状有很大益处。
柠檬叶可用于提取香料，柠檬鲜果表皮可以生产柠檬香精油，柠檬香精油既是生产高级化妆品的重要原料，又是生产治疗结石病药物的重要成分；果胚还可生产果胶，橙皮苷，果胶既是生产高级糖果、蜜饯、果酱的重要原料，又可用于生产治疗胃病的药物；橙皮苷主要用于治疗心血管病；果胚榨取的汁液既可生产高级饮料，又可生产高级果酒；果渣可作饲料或肥料；种子可榨取高级食用油或者入药。因此柠檬全身都是宝，是加工绿色产品的重要原料。
